In dieser Episode sprechen Pierre Stallforth und Bernd Rupp über den "Jurassic Park für Antibiotika" und über soziale Amöben.

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Das Wirkstoffradio ist ein Wissenschaftskommunikationsprojekt aus dem Leibniz-Forschungsinstitut f\u00fcr Molekulare Pharmakologie (FMP) und wird gef\u00f6rdert durch das Leibniz Forschungsnetzwerk Wirkstoffe und Biotechnologie.","poster":"https:\/\/www.wirkstoffradio.de\/podlove\/image\/68747470733a2f2f7777772e7769726b73746f6666726164696f2e64652f77702d636f6e74656e742f75706c6f6164732f323031382f30392f5769726b73746f6666726164696f5f4c6f676f5f6c616e672d3330303078333030305f63726f707065645f626c756542472e706e67\/500\/0\/0\/wirkstoffradio","link":"https:\/\/www.wirkstoffradio.de"},"title":"WSR054 Pal\u00e4obiotechnologie und R\u00e4uber-Beute Beziehungen - Interview mit Prof. Dr. Pierre Stallforth","subtitle":"In dieser Episode sprechen Pierre Stallforth und Bernd Rupp \u00fcber den \"Jurassic Park f\u00fcr Antibiotika\" und \u00fcber soziale 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Prof. Dr. Pierre Stallforth ist Wissenschaftler am Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie, Hans-Knöll-Institut (HKI) in Jena. Pierre leitet dort die Gruppe Paläobiotechnologie und beschäftigt sich dabei unter anderem mit mikrobiellen Räuber-Beute Beziehungen von Mikroogranismen.


Prof. Dr. Pierre Stallforth; Quelle: HKI

Pierre erklärt, welche paläontologische Proben analysiert werden und wie man darin Mikroben bzw. Wirkstoffe findet, die von diesen Organismen hergestellt werden.


Außerdem diskutieren Pierre und Bernd die Räuber-Beute Beziehung von Amöben zu ihrem bakteriellen Futter.  Bakterien wehren Amöben häufig mit Wirkstoffen ab. Da Amöben wie auch der Mensch Eukaryonten sind, kann man diese Wirkstoffe nicht nur gegen Amöben nutzen, sondern potenziell daraus auch Wirkstoffe gegen Krebs entwickeln. Aber auch die durch Amöben verursachten Erkrankungen können schwerwiegend sein, so kann sich z.B. die Amöbe Naegleria fowleri durch den Riechnerv bis ins Gehirn fressen. Oder die Acanthamöben, die durch schlecht gepflegte Kontaktlinsen ins Auge verschleppt werden können und dort Hornhautentzündungen auslösen.

Sehr beeindruckend ist aber auch das Sozialverhalten der Amöben bei der Sporenbildung, während dieser sich 20% der Individuen für den Aufbau des Fruchtkörpers opfern. Manchmal werden dabei auch die Lieblingsbakterien mit eingebaut, um diese am neuen Standort aussähen zu können.



(Im Podcast gibt es Kapitelmarken, die den Zwischenüberschriften hier im Text entsprechen, so dass es einfacher ist, bestimmte Teile erneut zu hören. Nicht jede Kapitelmarke hat eine Zwischenüberschrift, manchmal fassen wir mehrere Kapitel zusammen.)


Was ist Paläobiotechnologie?

Paläobiotechnologie – HKI
Mundflora – Wikipedia Artikel
Zahnstein – Wikipedia Artikel
Biomineralisation – Wikipedia Artikel
Koprolith – Wikipedia Artikel
Paleofeces – Wikipedia Artikel
Mikrobiom – Wikipedia Artikel
Sequenzierung – Wikipedia Artikel
Desoxyribonukleinsäure (DNS, DNA) – Wikipedia Artikel
Christina Warinner – HKI
Christina Warinner – MPI
Fermentation – Wikipedia Artikel
Jurassic Park – Wikipedia Artikel

Mundmikrobiom früher und heute

Antibiotika – Wikipedia Artikel
Diät – Wikipedia Artikel

Was wird in den Daten gesucht?

Gen-Cluster – Wikipedia Artikel
Penicilline – Wikipedia Artikel
Tetracyclin – Wikipedia Artikel
Naturstoff – Wikipedia Artikel
Polyketide – Wikipedia Artikel
Nichtribosomale Peptide – Wikipedia Artikel
Terpene – Wikipedia Artikel
Terpenoide – Wikipedia Artikel

Wie ermittelt man die Funktion von Genen?

Künstliche Gensynthese – Wikipedia Artikel
Vektor (Biologie) – Wikipedia Artikel
Expressionssysteme – Wikipedia Artikel
Heterologous expression – Wikipedia Artikel (englisch)
Phylogenese – Wikipedia Artikel
Phylogenetischer Baum – Wikipedia Artikel
Brute-Force-Methode – Wikipedia Artikel
Bioinformatik – Wikipedia Artikel

Interaktion von Mikroben

Bakteriophagen – Wikipedia Artikel
Quorum sensing – Wikipedia Artikel
Räuber-Beute-Beziehung – Wikipedia Artikel
Selektionsdruck – Wikipedia Artikel
Amöbe – Wikipedia Artikel
Dictyostelium discoideum (soziale Amöbe) – Wikipedia Artikel

Was ist eine soziale Amöbe?

Vielzeller – Wikipedia Artikel
Multizellulär – DocCheck Flexikon
Spore – Wikipedia Artikel
Fruchtkörper – Wikipedia Artikel

Sporenbildung

Altruismus – Wikipedia Artikel
Soziobiologie – Wikipedia Artikel
Cheating – Leo Wörterbuch
WSR032 Naturstoffe aus symbiontischen Systemen – Interview mit Dr. Christine Beemelmanns – link zu Episode

Chrakter der Räuber-Beute-Beziehung

Mutualismus (Biologie) – Wikipedia Artikel
Antagonist (Ökologie) – Wikipedia Artikel

Die Beute der Amöbe

Agar – Wikipedia Artikel
Bakterienrasen – Wikipedia Artikel
Filamente – Wikipedia Artikel

Biofilme

Biofilm – Wikipedia Artikel
Signalstoffe – Spektrum der Wissenschaft

Analyse der Bakterientoxine

Deletion – Wikipedia Artikel
Knockout Mutante  – Wikipedia Artikel

Bekannte Wirkstoffe gegen Amöben

Violacein – Wikipedia Artikel (englisch)
amöbizid – PharmaWiki

Struktur von Violacein; Quelle: Tomasz Dolinowski, CC0, via Wikimedia Commons
Von Amöben ausgelöste Erkrankungen?

Amöbenruhr – Wikipedia Artikel
Keratitis (Hornhautentzündung) – Wikipedia Artikel
Acanthamöbiasis (amöbille Keratitis) – Wikipedia Artikel
Amöbenkeratitis – RKI
Acanthamoeba – Wikipedia Artikel
Dr. House/Episodenliste – Wikipedia Artikel

Die Betreffende Episode ist in Staffel 2 Episode 23 (Schlechter Scherz – Teil 2)
Naegleria fowleri (Gehirnfressende Amöbe) – Wikipedia Artikel
Krebs (Medizin) – Wikipedia Artikel
Kultivierung – Wikipedia Artikel

Andere Räuber in der Anzucht

Fadenwürmer (Nematoden) – Wikipedia Artikel
Caenorhabditis elegans – Wikipedia Artikel

Kooperative Effekte

Kooperativität – Wikipedia Artikel
Giftung – Spektrum der Wissenschaft
Bienengespräche – Homepage
Superorganismus – Wikipedia Artikel
Agrikultur – Wiktionary
Joan Strassman – Homepage Univertity in St. Louis
wissenschaftlicher Artikel (closed access): Brock, D.A., Jones, K., Queller, D.C. et al. Which phenotypic traits of Dictyostelium discoideum farmers are conferred by their bacterial symbionts?. Symbiosis 68, 39–48 (2016).

Die Studie befindet sich leider hinter einer Paywall, ist also nur für diejenigen zugänglich, die ein Abo der entsprechenden Fachzeitschrift haben. Daher werden wir nicht direkt auf den Artikel verlinken, sondern stellen euch den „Digital Object Identifier (DOI)“ zur Verfügung: doi: 10.1007/s13199-015-0352-0.

Aber die Wissenschaftler:innen stellen hier PDF’s ihrer Arbeiten zur Verfügung

Wie frisst eine Amöbe Bakterien

Phagocytose – Wikipedia Artikel
Weiße Blutkörperchen Leukozyt – Wikipedia Artikel

 Wirkstoffisolation

WSR034 Wirkstoffproduktion: Von der Flasche im Labor bis zum Tank in der Industrie – Interview mit Prof. Dr. Miriam Agler-Rosenbaum – Link zur Episode
Extraktion (Verfahrenstechnik) – Wikipedia Artikel
Essigester – Wikipedia Artikel
Butanol – Wikipedia Artikel
Chromatographie – Wikipedia Artikel
Kernspinresonanzspektroskopie (NMR) – Wikipedia Artikel
WSR007 Moleküle Atom für Atom untersuchen mit NMR-Spektroskopie – Interview mit Dr. Peter Schmieder – Link zur Episode

Was sind Lipopeptide und Alkaloide

Lipopeptide – Wikipedia Artikel
Amphiphilie – Wikipedia Artikel
Alkaloide – Wikipedia Artikel
wissenschaftlicher Artikel (open access): M. Klapper, S. Götze, R. Barnett, K. Willing, P. Stallforth: Bacterial Alkaloids Prevent Amoebal Predation; Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 2016, 55, 8944–8947. DOI: 10.1002/anie.201603312
wissenschaftlicher Artikel (open access): S. Götze, R. Herbst-Irmer, M. Klapper, H. Görls, K. R. A. Schneider, R. Barnett, T. Burks, U. Neu, P.   Stallforth: Structure, Biosynthesis, and Biological Activity of the Cyclic Lipopeptide Anikasin; ACS Chem. Biol. 2017, 12, 2498–2502. DOI: 10.1021/acschembio.7b00589
wissenschaftlicher Artikel (open access): J. Arp, S. Götze, R. Mukherji, D. J. Mattern, M. García-Altares, M. Klapper, D. A. Brock, A. A. Brakhage, J. E. Strassmann, D. C. Queller, B. Bardl, K. Willing, G. Peschel, P. Stallforth: Synergistic activity of co-secreted natural products from amoebae-associated bacteria; Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2018, 115, 3758–3763. DOI: 10.1073/pnas.1721790115
wissenschaftlicher Artikel (open access): S. Zhang, R. Mukherji, S. Chowdhury, L. Reimer, P. Stallforth: “Lipopeptide-mediated Bacterial Interaction Enables Cooperative Predator Defense” Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2021, 118, doi: e2013759118

 Werdegang von Pierre

Antibiotika-Krise: Warum tut sich so wenig? – Das Erste – ARD
Wege aus der Antibiotika-Krise – wissenschaft.de
Pierre Stallforth – Hompage
Siemens Stiftung – Wikipedia Artikel
Exzellenzcluster – an der Friedrich-Schiller-Universität Jena
Jon Clardy – Wikipedia Artikel (englisch)
Harvard Medical School – Wikipedia Artikel
WSR039 Biosynthetisches Design von Naturstoffen und gerichtete Evolution – Interview mit Dr. Hajo Kries – Link zur Episode
WSR030 Antibiotika & Resistenzen: Geschichte, gesellschaftliche Bedeutung und Antiinfektiva-Forschung – Interview mit Dr. Florian Kloß – Link zur Episode

Das Lieblingsmolekül von Pierre

Penicilline – Wikipedia Artikel
β-Lactam-Antibiotika – Wikipedia Artikel
Penicillin Synthese – Wikipedia Artikel
Hans Knöll – Wikipedia Artikel
Dorothy Crowfoot Hodgkin – Wikipedia Artikel
Der dritte Mann – Wikipedia Artikel

Grundstruktur der Penicilline, das R steht für Rest. An dieser Stelle kann die Struktur variiert werden um zum Beispiel die Selektivität für bestimmte Bakterien zu erhöhen; Quelle: Yikrazuul, Public domain, via Wikimedia Commons

Wir bedanken uns ganz herzlich bei Prof. Dr. Pierre Stallforth für die Zeit und seine Erläuterungen und Ausführungen zu seinem Forschungsgebiet.


Wir freuen uns immer über Feedback: per Mail unter [email protected], in den Kommentaren unter den einzelnen Episoden, über Twitter @wirkstoffradio oder auch als Bewertung bei iTunes/Apple-Podcasts oder panoptikum.social.


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Bernd Rupp


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