35. Get amplified after death

RNAポリメラーゼを固定したES細胞や組織切片上で作用させ、DNAバーコードを位置情報と共に読み出すZombieという技術を紹介しました。Show notes

俺の通勤電車にCellを読んでる女子が乗ってくるんだが (カクヨム)
In situ readout of DNA barcodes and single base edits facilitated by in vitro transcription, Askary et al., Nature Biotechnol 2019…今回、Sohが紹介した論文。Elowitz labより。
Zombieは、‘Zombie is Optical Measurement of Barcodes by In situ Expression’…の略。上手く言いましたね。
Synthetic recording and in situ readout of lineage information in single cells, Frieda et al., Nature 2017.…一分子mRNAイメージングとゲノム編集を組み合わせた細胞系譜の追跡技術MOEIRを開発したのもElowitz labであり、こちらの論文はPubmedから無料で読めます。
One-shot beautiful experiment. Researchat.fm…Ep09では細胞系譜の追跡技術、イメージングについて話しました。
Evolutionary selected life. Researchat.fm…今回の論文でも使われているABE (Adenine Base Editor)はA-to-Gの一塩基編集を行うゲノム編集技術の一つ。この技術開発の裏側については、ep22で話しました。
沈まぬ太陽 (Netflix)…言わずと知れた山崎豊子原作の名作ドラマ。全20話で少し長いですが、年末にぜひ一気見してください。
Researchat.fmお便りフォーム…感想やご意見などのお便りは一同、引き続きお待ちしております。

Editorial notes

細胞を固定してしまえばin situで高効率な反応が起こせる、という大胆な発想の転換こそがこの論文の全て（Soh）
ゾンビとブードゥー教、小泉八雲、バイオハザードあたりの話をいつかしたい (tadasu)
あとゾンビ映画詳しい人に話を伺いたいですね。(coela)