149. Syako Punch

kagayaさんをゲストに迎え、シャコパンチの話題を中心に色々話しました。Shownotes

Katsushi Kagaya
140. Recurrency (Researchat.fm) … “kagayaさんをゲストに迎え、アメリカザリガニの自発性行動開始の脳研究における単一ニューロンの膜電位活動の記録とその形態染色技術の話、超高速パンチをするシャコの研究、リカレントニューラルネットワークの機械学習フレームワークであるリザバーコンピューティングについてお話をうかがいました。 (w/ mazさん)”
kagayaさんの(Self-organized criticality 自己組織化臨界)SOC論文　準備電位は自己組織化臨界状態で生じる神経雪崩と呼ばれるスケールのない、冪則に従う神経活動であるという主張の論文　https://doi.org/10.48550/arXiv.2209.09075
リザバー … リザバー・コンピューティング(recurrent neural networkの機械学習法のひとつ)
Researchatfm sticker
リザバーハンドブック … Hands-on reservoir computing: a tutorial for practical implementation
リザバーのコード … Simple Echo State Network implementations で、Echo State Network のミニマルな実装が、R、Julia、Python、MATLABのそれぞれの実装が公開されています。
Herbert Jaeger
かがやさんの文章 … 超高速運動から個性そして多様性
ゆるふわ生物学のシャコパンチ回
シャコパンチ … 主にパンチして貝殻を割って食べるタイプのスマッシャーシャコの打撃運動のことをシャコパンチと言っているが、突き刺すのが得意なスピアラーシャコもパンチをする。スピアラーシャコに破られた水槽
Sheila Patek
The shrimp with a kick! … Sheila Patek先生のTED
テラフォーマーズ
海の牙 … 勝手に拝借失礼いたします。星野之宣先生の作品のようです。
えびボクサー … “邦題は『えびボクサー』で公式ポスターにもエビが描かれているが、実際に登場するのはシャコである。”
Mantis shrimp … シャコの英語での一般の呼び方。
Roy Caldwell … シャコ界のゴッドファーザー
133. The longest self-introduction … “mazさんをゲストに迎え、自身の研究の変遷を軸に、バイオメカニクスのおもしろさを話していただきました。”
ハイスピードカメラ
Malcolm Burrows
スピアラー・スマッシャー　…　機能的に主にこのふたつに大別される。中間タイプもいる。
水槽を割るスピアラー
自分の指が刺さっている論文 … The mechanics and neural control of the prey capture strike in the mantid shrimps Squilla and Hemisquilla 刺されたところ
顎脚
Patekさんの最初の論文 … Deadly strike mechanism of a mantis shrimp
スピアラーを測った論文 … Strike mechanics of an ambush predator: the spearing mantis shrimp
空気中でパンチが遅くなる … Medium compensation in a spring-actuated system
キャビテーション
シャコパンチが光る動画
テッポウエビ
ヨコエビ
テッポウエビの2000年の論文 … How Snapping Shrimp Snap: Through Cavitating Bubbles
テッポウエビの動画
Kaji-sanの論文 … Parallel Saltational Evolution of Ultrafast Movements in Snapping Shrimp Claws
「回転中心乗り越えて」 … 意味不明だったと思います。「作用点がもと回転中心だったところを乗り越えて」に訂正します。
シャコパンチの4棒リンク機構モデル
「スピード優先」 … スマッシャーは速いのですが、このリンク機構だけの説明では「フォース優先」としないと間違い。変位が小さくなるとスピード小さくなっちゃうので。
筋肉の並列構造　カニの筋肉の羽状配置
Animal Physiology: Adaptation and Environment
(休憩)
ザリガニをサクリファイスしていた話 … Researchat.fm ep140でお聴きになれます。
(Probability of success)(Value)/Time = PV/T
Kagaya and Patek, J Exp Biol (2016) … “Feed-forward motor control of ultrafast, ballistic movements”
ダーウィンが来た！
EMG … electromyography 筋電図
混合分布モデル 確率分布を混合した分布 … 「モデルの中では」と言っていますが、データでモデルを学習する段階では5個体分かれているけど、予測のときには(全体の線をひくときには)分かれてないということを言うべきでした。lme4
Stan … “Stan is a state-of-the-art platform for statistical modeling and high-performance statistical computation. Thousands of users rely on Stan for statistical modeling, data analysis, and prediction in the social, biological, and physical sciences, engineering, and business.”
シャコのブラッシング、グルーミング
シャコの眼 … 偏光が見える・感じられる
シャコの「驚異の色覚」は幻想だった？
Kagaya and Takahata, Science (2011) … “Sequential synaptic excitation and inhibition shape readiness discharge for voluntary behavior”
SKK
ritualized behavior … Contests with deadly weapons: Telson sparring in mantis shrimp (Stomatopoda)
meral spread … 上の論文の図版
Kagaya and Takahata, Science (2011) … “Sequential synaptic excitation and inhibition shape readiness discharge for voluntary behavior”
白眉プロジェクト
神経系はなぜ東なのか
下澤楯夫
並列構造　… e.g., 神経の束、イオンチャネルなど
コオロギのセンサー　コオロギやゴキブリの仲間にある尾葉という気流感覚器
ハマホト … 浜松ホトニクス
ザリガニのジャイアントニューロンと逃避行動　2本の腹髄の横断面をみると二対の巨大軸索が見える。外側と内側にそれぞれ lateral giant と　medial giant と言われるニューロンがある。それぞれ後方と前方からの脅威（水流刺激）に一発のスパイク応答を示して脅威から遠ざかる逃避遊泳を「司令」するため、コマンドニューロンとも言われた。コマンドという、ニューロン活動と行動が一対一に対応するという概念は感覚における「おばあさん細胞」のいわば運動版である。
「神経系は東」タグ
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Editorial Notes

こちらこそ楽しく自分のお話させていただいてありがたいです。シャコやカニを食べる時、その筋肉繊維の向きを見て思い出していただければ幸いです。(kagaya)
メチャクチャ楽しく聴けました。シャコ、今度日本に帰ったら食べます（違(tadasu)