OSR022 Open Bioinformatics mit Hilmar Lapp

Wir streifen ja in diversen Folgen immer mal wieder das Thema Biologie oder Bioinformatik. Zum einen natürlich weil aus dieser Fachrichtung sehr viel Open Science Aktivität kommt, zum anderen natürlich weil das Konrad's Haus- und Hofthema ist. Und am Rande haben wir sicher auch schon einmal die Open Bioinformatics Foundation (OBF) erwähnt. Pünktlich zur just an diesem Wochenende stattfindenden BOSC, der Annual Bioinformatics Open Source Conference 2014, haben wir uns mit Hilmar Lapp nicht nur den aktuellen Präsidenten der OBF eingeladen, sondern auch einen der Initiatoren der BOSC. Hilmar war so freundlich uns ein bißchen seiner Zeit zu schenken und wir haben mit ihm über seinen eng mit der OBF verknüpften Weg in der Open Source und Open Science Bewegung gesprochen.

Wir streifen ja in diversen Folgen immer mal wieder das Thema Biologie oder Bioinformatik. Zum einen natürlich weil aus dieser Fachrichtung sehr viel Open Science Aktivität kommt, zum anderen natürlich weil das Konrad’s Haus- und Hofthema ist. Und am Rande haben wir sicher auch schon einmal die Open Bioinformatics Foundation (OBF) erwähnt. Pünktlich zur just an diesem Wochenende stattfindenden BOSC, der Annual Bioinformatics Open Source Conference 2014, haben wir uns mit Hilmar Lapp nicht nur den aktuellen Präsidenten der OBF eingeladen, sondern auch einen der Initiatoren der BOSC. Hilmar war so freundlich uns ein bißchen seiner Zeit zu schenken und wir haben mit ihm über seinen eng mit der OBF verknüpften Weg in der Open Source und Open Science Bewegung gesprochen.

Hin und wieder hat uns Skype einen Streich gespielt, wir hoffen aber, dass das nicht weiter störend ist. Viel Spaß beim Hören!

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Shownotes: OSR022 Open Bioinformatics mit Hilmar Lapp

Begrüßung 00:00:00

Open Knowledge Festival 2014; — Hilmar Lapp; — Open Bioinformatics Foundation (OBF);.

Zur Person 00:02:20

(Biologie- und Informatikstudium an der Uni Freiburg;)  — Novartis Forschungsinstitut in Wien; — Funktionale Genomik; — Target Identifizierung; — Novartis Institute for Functional Genomics; — GNF Genomics Institute of the Novartis Research Foundation; — Angewandte Bioinformatik; — NESCENT; — NSF National Science Foundation; — Evolutionsbiologie; — Evolutionswissenschaften; — Evolutionstheorie; — Charles Darwin; — Sozialdarwinismus; (Director of Informatics - Duke Center for Genomic and Computational Biology (GCB);)  — Bioinformatik; — Molekularbiologie; — Molekulargenetik; — Physik; — High Performance Computing; — Cloud Computing;.

Open Bioinformatics Foundation und Projekte 00:19:48

Open Source; glossary — Bioinformatics Open Source Conference BOSC; — Open Bioinformatics Foundation (OBF); — OBF Projekte; link — Öffentliche Konsultationen; — NIH; — Prinzipien der OBF; — ISMB Conference; — Computational Biology; — OBF Hackathons und Codefest; — Beitrag von Hilmar zu BioPerl db und BioSQL; — DataDryad; — GenBank; — PDB; — Finanzierungsmodell von Dryad; — Dryad Funding und Reporting; — Data from: 40 years of evolution. Darwin's finches on Daphne Major Island; — Data Obersavtion Network for Earth DataONE; — DataONE CCIT; — IEvoBio Conference; — Data Sharing; — Reproducibility;.

Epilog 01:11:41

Research Data Alliance RDA; — BOSC 2014 video recording; — Hilmar auf Twitter; — Hilmar's Blog;.