Meta PHoDcast 103: Jakob Rupert, biokemik

Z Jakobom Rupertom o fazni ločbi proteinov, molekuli RNA in spopadanju z neuspehom. #MetaPHoDcast Jakob Rupert je doktorski študent genetike in molekularne biologije na...

Z Jakobom Rupertom o fazni ločbi proteinov, molekuli RNA in spopadanju z neuspehom.

#MetaPHoDcast

Jakob Rupert je doktorski študent genetike in molekularne biologije na univerzi Sapienza v Rimu. Diplomiral in magistriral je na Fakulteti za kemijo in kemijsko tehnologijo, Univerze v Ljubljani. Raziskovanje v okviru doktorske naloge z delovnim naslovom “Using RNA aptamers to prevent protein aggregation in ALS” opravlja na italijanskem inštitutu za tehnologijo (IIT) v Genovi, pod mentorstvom prof. dr. Giana Gaetana Tartaglie.

Vloga proteinov pri bolezni
amiotrofična lateralna skleroza (ALS) predstavlja rdečo nit Jakobovega raziskovanja že od svoje diplomske naloge,
 kjer je raziskoval vlogo proteinov jedrnega transporta pri ALS. Kasneje
 se je na praksi v Stockholmu ukvarjal še s kinetiko vezave novega
modulatorja muskarinskih acetilholinskih receptorjev, na magisteriju s
kristalizacijo novega proteina, povezanega z ALS, ter nazadnje na praksi
 v Londonu, z agregacijskimi študijami ALS proteina TDP-43 iz
 kratkoživeče ribe.

Tema njegovega doktorskega raziskovanja je vpliv molekul 
ribonukleinske kisline (RNA) na fazno ločbo in agregacijo proteinov (kaj to je,
 razloži v podkastu). Bolj konkretno se ukvarja z načrtovanjem sinteznih RNA
 molekul oziroma RNA aptamerov in njihovim vplivom na fazno ločbo, agregacijo in celično
funkcijo proteina TDP-43, ki je eden glavnih dejavnikov pri bolezni ALS.

Od predsednika vlade bi si predvsem želel (kot velika večina njegovih kolegov),
 da se uredi financiranje podoktorskih raziskovalcev, ki si po študiju in raziskovalnem delu v tujini želijo vrniti v Slovenijo, ostati
 v raziskovanju ter z znanjem in izkušnjami, pridobljenimi v tujini, pozitivno vplivati na razvoj slovenske znanosti.

Svojim kolegom priporoča, da najdejo način organizacije, ki jim ustreza ter se naučijo spopadati z neuspehom, ki sestavlja veliko večino raziskovalnega življenja, zato da vztrajajo in se prebijejo do tistih preostalih nekaj odstotkov, kjer se skrivajo nova odkritja.

Poslušalcem priporoča knjige Skrivna zgodovina (D. Tartt),  Rule Britannia (D. Dorling, S. Tomlinson), Free Will (Sam Harris), ter filme Ne bom več luzerka, Dawn Wall in Parada.

Na svoji večerji bi imel več omizij, med katerimi bi se po želji selil. Povabljeno druščino sestavljajo Christopher Hitchens, Douglas Adams in Kurt Vonnegut za debate, Alex Honnold za navdih, 10th Doctor za vzdušje, Anthony Bourdain za catering, Ray Manzarek za glasbeno spremljavo in Noel Fielding in Richarda Ayoade kot najljubša komika.

—

Meta PHoDcast so pogovori z mladimi raziskovalci in raziskovalkami o življenju, vesolju in sploh vsem. Gostitelji in gostje smo znanstveniki in znanstvenice z različnih področij znanosti. Večinoma gre za doktorske študente in študentke pred zaključkom doktorata, občasno pa so naši sogovornik tudi podoktorski raziskovalci in raziskovalke v tujini.